Fanno la loro prima apparizione nella
serie classica, nel serial La sconfitta degli Zigoni. In tale occasione è il
Quarto Dottore ad affrontarli; gli alieni erano guidati dal comandante
Broton, che viene ucciso dal
Brigadiere Lethbridge-Stewart.
Gli Zygon riappaiono poi nella nuova serie, nell'episodio speciale del cinquantesimo anniversario di Doctor Who, Il giorno del Dottore, dove viene rivelato che il loro pianeta è stato distrutto in conseguenza dell'Ultima Grande Guerra del Tempo. Sempre nel cinquantenario essi cercano di impadronirsi della tecnologia segreta della UNIT, ma il Decimo e l'Undicesimo Dottore, aiutati dal War Doctor, riescono a sventare i loro piani.
Gli Zygon sono tornati nella nona stagione in un doppio episodio.